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Nogo66蛋白质的氨基酸序列分析

http://www.cnophol.com 2009-8-11 9:29:34 中华眼科在线

  作者:岳红云,贺翔鸽,燕振国,马岩梅   

  作者单位:(730050)中国甘肃省兰州市,兰州军区兰州总医院眼科;(400042)中国重庆市,第三军医大学大坪医院眼科

  【摘要】    目的:分析Nogo66蛋白的氨基酸序列特征,分析其产生免疫应答的机会。方法:ProPred web interface程序,ProPred MHCII Binding Peptide prediction Server抗原表位分析软件,对Nogo66蛋白进行分析,查找T细胞抗原表位,分析分子量及氨基酸残基特征。结果:Nogo66蛋白有6个重复率最高的T淋巴细胞受体识别的抗原表位: LGHVNCTIK VQKYSNSAL LVQKYSNSA LRRLFLVDD YKGVIQAIQ FLVDDLVDS,铆钉残基明确。结论:Nogo66蛋白的氨基酸序列决定了其可能具备免疫原性,具有刺激免疫系统产生T淋巴细胞介导的免疫反应的分子基础。

  【关键词】  Nogo 66蛋白 氨基酸序列 神经免疫保护

  0引言
   
  中枢神经系统(central nervous system,CNS)损伤与修复过程中,Nogo因子不仅抑制神经纤维再生,而且Nogo基因表达上调可促进神经元凋亡和死亡的发生。Nogo蛋白的碳端和氮端在细胞膜内,而胞膜外由66个氨基酸残基形成拓扑结构—Nogo66,Nogo66通过与细胞表面受体NgR的配体受体式结合,介导了Nogo的中枢神经抑制活性。由于Nogo66为损伤后大量表达的内源性损伤因子。重组Nogo66蛋白如果能够激活特异性T淋巴细胞,则可成为神经损伤后的特征性免疫保护抗原。根据Nogo66蛋白的氨基酸序列进行生物信息学分析其分子特征,预测Nogo66蛋白的T淋巴细胞抗原表位。从而初步判断Nogo66蛋白可能与MHCII分子结合的程度及其提呈抗原表位肽段激活T淋巴细胞,产生免疫应答的机会。为利用Nogo66蛋白进行神经免疫保护的进一步实验提供依据[1]。

  1材料和方法

  1.1材料  重组基因表达得到的Nogo66蛋白与文献氨基酸序列相同,其中有3个酪氨酸残基,1个苯丙氨酸残基:RIYKGVIQAIQKSDEGHPFRAYLESEVAISEELVQKYSN SALGHVNCTIKELRRLFLVDDLVDSLK。分子量:7.53461kDa。

  1.2方法  预测T淋巴细胞抗原表位所应用的程序:ProPred web interface程序,ProPred MHC ClassII Binding Peptide Prediction Server抗原表位分析软件。 预测抗原序列中的MHC ClassII接合区域,通过预测抗原的氨基酸/位置系数,根据Sturniolo等(1999)推论出的线性预测模型,即基于预测方式的定量矩阵。得出已知抗原的等位基因特异性接合区域。确定抗原的定位泛宿主性的(质粒广谱宿主性)或等位基因特异性结合范围。选择最低假阳性率结果,忽略最高假阴性率,确定1%为筛选几率。确定锚钉蛋白位置。

  2结果
   
  应用ProPred MHC ClassII Binding Peptide Prediction Server抗原表位分析软件分析Nogo66蛋白的T细胞抗原表位如下:(略)

  结果可知,Nogo66蛋白的T细胞抗原表位在针对人MHC ClassII分子的51个等位基因中,Nogo66蛋白有LGHVNCTIK VQKYSNSAL LVQKYSNSA LRRLFLVDD YKGVIQAIQ  FLVDDLVDS 6个重复率最高的T细胞抗原表位,上述抗原表位的锚钉残基(黑体)能够针对人MHC分子结合,启动免疫应答。即Nogo66蛋白具有明确的抗原性,为免疫原性较高的蛋白质。锚钉残基的位置为斜体显示的氨基酸位点。

  3讨论
   
  神经免疫保护研究发现,通过眼内损伤部位大量增多的免疫原性物质进行免疫接种,能够有效激活特异性T淋巴细胞介导的保护性自身免疫反应,对损伤神经元进行免疫保护[2,3]。T淋巴细胞介导的免疫反应能够保护处于边缘性损伤的神经节细胞[4]。我们前期通过基因重组表达的Nogo66蛋白,其氨基酸序列与内源性Nogo66蛋白完全相同,如果具备免疫原性,则有可能成为介导损伤的内源性Nogo66蛋白的竞争性抑制抗原[5]。发挥抑制—抑制的神经保护作用。另外,通过对细胞免疫的激活,产生针对损伤抗原Nogo66的特异性T淋巴细胞[6],产生特异性的T淋巴细胞介导的神经免疫保护。
   
  具有免疫原性的外源性蛋白质多为分子质量>5000Da的蛋白质。但是,如果在氨基酸长链中加入酪氨酸和苯丙氨酸,当蛋白质的分子量达到4000Da时,即可显示免疫原性。基因重组表达得到的Nogo66氨基酸序列与文献氨基酸序列相同,钛链中包括3个酪氨酸残基,1个苯丙氨酸残基。其分子量为7534.61kDa。
   
  蛋白质分子中能够被MHC分子提呈并且被T淋巴细胞受体(T cell receptor,TCR)识别的肽段称为T细胞表位(T cell epitope)[7]。抗原表位是提呈给T淋巴细胞并激活后者的特殊肽段。针对外来抗原T淋巴细胞在诱导免疫应答的过程中起到关键作用,抗原固有肽段中某些片断必须能够与T细胞主要组织相容性抗原(major histocompability complex,MHC)分子结合[8]。通过抗原表位分析,可知,Nogo66蛋白有6个重复率最高的T细胞抗原表位,存在与MHCII系统紧密结合的铆钉蛋白位置。有刺激免疫系统产生T淋巴细胞介导的免疫反应的分子基础。
   
  慢性高眼压损伤后的视网膜有广泛的Nogo蛋白表达,并与损伤程度密切相关[9]。重组Nogo66蛋白是否具有免疫原性决定其能否通过Nogo66蛋白接种,增强特异性T淋巴细胞介导的免疫反应,达到对受损的RGCs保护作用[10]。因此,通过对Nogo66蛋白的氨基酸序列分析,对于进一步研究Nogo66蛋白的神经免疫保护作用,为青光眼的治疗提供新的神经保护思路,具有重要意义。

  【参考文献】

  1岳红云,贺翔鸽,谢琳.Nogo66蛋白的免疫原性研究.中华眼科杂志 2008;44(6):565567

  2 Yang J, Patil RV, Yu H, et al. T cell subsets and sIL2R/IL2 levels in patients with glaucoma. Am J Ophthalmol 2001;131(4):421426

  3 Moalem G, LeibovitzAmit R, Yoles E, et al. Autoimmune T cells protect neurons from secondary degeneration after central nervous system axotomy. Nat Med 1999;5(1):4955

  4 Lenzlinger PM, Shimizu S, Marklund N, et al. Delayed inhibition of NogoA does not alter injuryinduced axonal sprouting but enhances recovery of cognitive function following experimental traumatic brain injury in rats. Neuroscienc 2005;134(3):10471056

  5 Walmsley AR, Mir AK, Frentzel S. Ectodomain shedding of human Nogo66 receptor homologue1 by zinc metalloproteinases. Biochem Biophys Res Commun 2005;4(327):112116

  6 Al Halabiah H, Delezoide AL, Cardona A, et al. Expression pattern of Nogo and NgR genes during human evelopment. Gene Expr Patterns 2005; 5(4):561568

  7周光炎.免疫学原理.第1版.北京:科学技术出版社 2005:107109

  8龚非力.医学免疫学.第1版.北京:人民卫生出版社 2004:113114

  9马建洲,贺翔鸽,谢琳,等.慢性高眼压青光眼动物模型的构建和鉴定.国际眼科杂志 2007;7(4):12031205

  10马建洲,贺翔鸽.免疫系统与青光眼.国际眼科杂志2007;7(5):13791383

(来源:互联网)(责编:xhhdm)

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